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医学服务

临床案例

1. 高精准解析复杂结构变异导致的D--

    上海市血液中心联合潍坊市人民医院、西安浩瑞基因团队共同解析人类血型基因最复杂的结构变异,研究选取了一例具有D--表型的先证者及其家系,通过PacBio HiFi扩增子测序数据及29个单核苷酸变异(SNVs)杂合位点等信息手动组装了RHCERHD的6个基因单倍型,结合Bionano OGM结果、杂合位点信息及遗传关系确定了3个具有结构变异的RHCE单倍型,并确定了这些单倍型在先证者家族中的遗传关系。该项研究成果发表于血液学领域Top期刊Blood Advances(IF=7.5)。


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        浩瑞基因原创设计RHCE/RHD复杂血型检测体系。这两个基因是人类红细胞血型系统中最复杂的成员,长60kb、同源性96-98%,极易发生重组/倒位等复杂结构变异,传统技术难以精准分型。针对最复杂的D--分型,浩瑞基因自主研发的三代血型分型技术可实现精准检测,全面覆盖人类Rh血型的所有常规、复杂及疑难分型。


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图.参考RH和SV单倍型模型图谱

    经证实,针对高同源、高重组率的RH基因区域,PacBio长读长测序是破解复杂结构变异的关键。

相关数据发表于:Li M, Wang L, Li A, et.al. Blood Adv. 2024; 8:3154–65.


2. 发现Rhmod表型相关的RHAG新等位基因(c.500A>G)

简介:贫血患者,表现为红细胞血红蛋白减少。

实验室检查:RhD、C、c、E和e抗原均为阴性,推测为Rhnull表型(Rh抗原未表达)或Rhmod表型(弱表达)。使用三种不同的抗-D试剂,IAT结果均为极弱凝集(±),而微柱凝胶试验凝集反应略强(+),推断为Rhmod表型。血清抗体筛查结果阴性(由于缺乏针对RhCE抗原的IgG抗体,间接抗人球蛋白试验和吸附放散试验未进行)。

PCR-SBT:外显子未发现变异。基因型分别为RHD*01/RHD*01RHCE*02/RHCE*02

浩瑞PacBio测序:

(1)测序结果与PCR-SBT一致。通过RHAG基因的全长测序发现,其第4外显子存在c.500A>G纯合错义变异,该变异导致RhAG蛋白第167天冬氨酸变为甘氨酸(p.Asp167Gly),未收录于NCBIdbSNP数据库。

2)该变异位点位于RhAG蛋白的第三个胞外环中(与铵盐转运密切相关),推测可能改变蛋白表位或影响与RHD、RHCE蛋白的结合,从而形成Rhmod表型。新Rhmod等位基因被ISBT红细胞免疫遗传学和血型术语工作组暂定命名为RHAG*01M.18


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文献:Hong X, Huang X, Zhang J, et.al.Transfusion. 2025 Feb; 65(2):E7-E9.


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