1. 泛基因组的构建策略有哪些？
使用参考基因组的话可以用各个材料的测序reads分别比对，将未比对上的reads进行组装，通过“比对-组装”的迭代过程构建；或者所有材料进行基因组从头组装，通过从头组装的基因组进行相互比较来构建泛基因组；最后则是基于变异图的泛基因组构建。
2. 泛基因组的材料应该如何选择？
首先材料要覆盖遗传多样性，优先选择来自不同地理区域、生态类型、亚群或驯化背景的个体；其次应避免亲缘关系过近，亲缘关系太近的材料会低估泛基因组规模；应结合野生与驯化或栽培材料，野生种通常携带更多非核心基因，有助于发现驯化过程中丢失的功能基因。
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