基因组De novo测序分析也被称作从头测序分析，指不依赖于任何参考序列信息就可对某动植物进行测序分析，使用生物信息学方法进行序列拼接获得某物种的基因组序列图谱，并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。基于三代测序技术的长读长的特点，可以快速高效获取长读长、高质量的测序数据，组装简单和复杂的高质量基因组。
分析内容
基因组序列是研究物种分子生物学的基础，通过全基因组De novo测序， 可得到物种全基因组序列图谱。
De novo测序 | 分析内容 |
组装 |
|
注释 |
|
Hi-C辅助基因组组装 | 有效数据评估；Contig聚类、排序及定向分析；挂载结果评估 |
De Novo测序的优势
1. 针对复杂或多倍体基因组，可以获取生成准确的参考序列
2. 绘制新型生物的基因组图谱或完善已知生物的基因组提供有用的信息
3. 阐明高度相似或重复的区域，便于准确的de novo组装
4. 鉴定结构变异和复杂重排，如缺失、倒位或易位
微信二维码