真核有参转录组测序采用二代测序平台,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序。通过与参考基因组比对,即可全面快速分析mRNA序列和丰度信息、对基因结构和产生的新转录本进行分析。对于没有参考基因组的物种,真核无参转录组测序通过对测序数据进行拼接,以unigene为参考序列进行后续分析,为研究无参考基因组物种的转录水平变化提供有力的技术手段。
应用方向
动植物生长发育:分析发育过程或生长过程时空特异性表达的基因集,描述生长图谱
胁迫研究:研究胁迫环境下的机体响应机制
性状差异:寻找研究对象重要性状或表型
互作关系研究:通过转录水平寻找到关键调节的基因或者代谢通路,研究宿主与寄主之间相互作用关系
技术路线
