1. Hi-C推荐测序深度为多少？
一般互作、TAD、区室层级分析推荐100X，因为测序深度越高，分辨率越高。根据人、小鼠等项目经验，150X的测序数据量可支持10Kb分辨率下的loop分析，对于其他物种，建议根据基因组大小和项目目标咨询技术人员。
2. 染色质层级结构以及其特点有哪些？
（1）Compartment A/B （区室，常染色质/异染色质）；
（2）TAD（拓扑结构域）：区室中作用最为频繁的单元。边界具有保守性，富含CTCF结合位点、活跃转录标记；
（3）LAD（层关联域）：区室中作用较弱的单位，主要由转录沉默染色质组成，富含异染色质组蛋白H3K27/9me3；
（4）Loops（染色质环）：TAD中互作频率高于周围区域，比如启动子-增强子结构；Loops层级结构更精细，能够达到调控元件结合/基因层面。
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