泛基因组由 Tettelin 等人于 2005 年首次在细菌中提出,指一个生物分支(如一个物种)的全部基因组信息,可分为由所有个体共享的核心基因组和部分个体共享或个体特异性的非必需基因组组成。其中,核心基因组一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性;非必须基因组一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征相关,反映了物种的特性。运用高通量测序及生物信息分析手段,针对不同种/亚种/品系材料进行文库构建及三代长度长测序,并分别进行组装,可以构建泛基因组图谱。基于该图谱可以构建图形变异库,包括 SV 和 PAV 变异,丰富该物种的遗传信息,研究其重要生物学问题。
技术路线
应用方向
1. 物种起源及演化
2. 重要性状相关基因资源及科学育种
3. 适应性进化
4. 外来物种入侵性