1. 如何保证组装结果的可靠性？
对于组装的结果，除了保证Contig N50和Scaffold N50两项指标外，还需要对组装质量进行评估。如根据OrthoDB 数据库中进化分支eudicots 的通用单拷贝直系同源基因集（BUSCOs）预测基因组现有序列的基因情况，进而评估组装基因组的完整性，对比基因组，统计下机 reads 比对率、深度、 GC 含量，统计序列一致性等。
2. 基因组denovo和Survey 所用DNA是否需要一样的？
原则上进行Survey和denovo使用的DNA是来自一个个体的。如果DNA量不足以满足整个denovo项目，则建议小片段文库的DNA必须来自同一个体，大片段文库使用同一群体的另一个个体。
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