Hi-C 技术源于染色体构象捕获技术,以整个细胞核为研究对象,研究全基因组范围内整个染色质 DNA 在空间位置上的关系,通过对染色质内全部 DNA 相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息。与WGS、RNA-seq、ATAC-seq、 CUT&Tag等多组学联合分析,可以研究不同物种基因组空间结构(compartment、TAD、loop结构),从而揭示基因组三维结构,解析肿瘤/疾病/物种进化的发生发展机制。
实验流程
应用场景
1. 量化在三维空间中基因组的染色质间交联(cross-linked chromatin )
2. 解析全基因组互作模式,如启动子和增强子互作
3. 构建三维空间结构模型,如研究基因组三维结构特征:compartment,TAD,loop等
4. 构建全基因组互作图谱
5. 辅助提升基因组组装
6. 构建基因组单体型图谱