细菌完成图是指不需要任何现有序列信息,通过长读长测序以及生物信息学分析手段对得到的细菌物种的完整基因组及质粒序列。相比传统基于二代测序的框架图,细菌完成图可以更加准确、全面的描述细菌基因组的实际组成情况,对于基因功能研究、进化分析、工程菌改造、诊断试剂开发等有着显著价值。
实验流程
Pacbio 测序技术对样品 DNA 的要求非常高,浩瑞基因对客户提供的 DNA 进行严格的样品检测,从源头上保证质量。对检测合格的样品建库、上机测序,每个环节都严格把控,保证测序数据的准确性和 PacBio 测序长读长的特性。首先提取高质量的 DNA,之后进行构建文库,文库构建完成后利用 Pacbio Revio 系列测序仪对 DNA 进行单分子实时荧光测序,获得原始测序数据。
实验流程如下图所示:

分析流程
测序获得物种的组学数据后,对数据质量进行评估,利用高质量的数据进行组装得到基因组,进而对组装得到的基因组进行相关质量评估。
具体分析流程如下图:

应用领域
病原微生物研究:人类感染性疾病、动物和植物感染;
工业微生物应用:抗生素生产、生物发酵、能源利用;
环境科学:环境治理、微生物资源利用;
微生物分类与进化研究:新物种鉴定、进化关系分析、合成生物学与基因工程、基因编辑与改造、合成基因组设计。