1. 相比二代转录组，三代全长转录组在转录本结构解析上具备什么优势？
三代全长转录组可直接读取完整的 mRNA 全长序列，无需通过短片段拼接，能精准识别可变剪接、融合基因及新转录本，有效避免二代转录组拼接错误、转录本结构不完整等问题，同时可准确区分高度同源的同源异型转录本，为转录本注释和调控分析提供真实完整的序列信息。
2. 在非模式物种的功能基因组研究中，三代全长转录组能够发挥什么作用？
对于缺乏高质量参考基因组的非模式物种，三代全长转录组可直接构建完整的全长转录本集，精准完成 CDS 预测、基因功能注释及非编码 RNA 鉴定，弥补无参物种转录本信息碎片化的短板，为基因家族分析、分子标记开发、抗逆机制研究等提供高质量的转录本数据支撑。
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