Nanopore 测序基于电信号检测技术,通过单分子 DNA 或 RNA 链通过生物纳米孔时引起的电流变化,直接判读碱基组成。其核心元件是由蛋白质构成的纳米级通道,即 “Pore”。该纳米孔蛋白被嵌入高阻抗生物膜中,膜两侧置于含电解质的水溶液内;当膜两侧施加电压差时,离子会穿过纳米孔形成稳定电流。当单链 DNA/RNA 分子通过纳米孔时,会对离子流通产生特异性阻碍。由于不同碱基的化学结构存在差异,单个碱基或碱基单元通过孔道时会产生特征性电流扰动。通过对这类电信号进行实时捕获与算法解析,即可精准识别对应的碱基类型,完成序列测定。

建库流程

ONT 测序优势
1. 极限读长
超长的测序读长,可跨越高重复,低复杂度区域。可以很好的解决 NGS 测序无法解决的高杂合基因组组装、高重复序列等问题。
2. 直接测序
直接对 DNA/RNA 单分子进行测序。无需 PCR 扩增,没有 GC 偏好性,可直接读取甲基化修饰信息。
3. 测序成本低
相比于其他测序技术,Nanopore 测序对样本处理极其简单,无需 DNA 聚合酶或连接酶,无需 dNTPs。
4. 支持微量建库
起始DNA投入量极低,仅需10 ng–500 ng总RNA或DNA即可完成建库。