基因组survey以二代测序技术为基础,基于小片段文库的低深度测序,通过K-mer分析,快速获得基因组大小、杂合度、重复序列比例等基本信息,为制定该物种的全基因组de novo测序策略提供有效依据。
分析内容
1. 评估基因组大小;
2. 评估基因组杂合情况;
3. 评估重复序列含量;
4. 评估基因组GC含量;
5. 为后续基因组组装文库构建提供策略建议。
结果展示
Kmer=21 最大计数为108的频率分布线性图